2006 год.

Первое золото.

2006 год «Рубин» встретил с новым президентом. Ещё осенью 2005 года руководителем клуба стал Александр Петрович Гусев, сменивший на этом посту Камиля Шамильевича Исхакова. Перед командой в чемпионате России была поставлена задача занять место, которое позволит снова участвовать в европейских кубковых турнирах. В августе «Рубин» во второй раз в своей истории стартовал в Кубке УЕФА. Во втором отборочном раунде казанцы без труда прошли белорусский БАТЭ (3:0 дома и 2:0 в гостях). На следующем этапе казанцы уступили «Парме» из Италии (оба матча 0:1). Чемпионат России «Рубин» закончил на пятой строчке, что позволило ему в следующем сезоне сыграть в Кубке Интертото.

Барселона-Рубин 1:2

В сезоне 2007 года снова произошла серьёзная реконструкция в составе команды. «Рубин» пополнила целая группа игроков, однако лишь некоторые из них остались в команде в следующем сезоне 2008 года. Всему виной неудачное выступление команды: 10 место в чемпионате России и проигрыш в Кубке Интертото старым соперникам из венского «Рапида». Сезон был омрачён гибелью защитника Ленара Гильмуллина. Ленар был единственным воспитанником «Рубина», выступавшим в тот момент за основной состав команды.

В сезоне 2008 года «Рубин» отмечал полувековой юбилей. Подготовка к нему началась уже в конце 2007 года. В межсезонье руководство клуба провело серьёзную селекционную работу. В команду были приглашены игроки с большим опытом выступления на высоком уровне, такие как: Сергей Семак, Саво Милошевич, Сергей Ребров. Здорово вписались в коллектив турецкий полузащитник Гёкдениз Карадениз, защитник из Аргентины Кристиан Ансалди, вратарь Сергей Рыжиков. Вернулся в команду её старожил, защитник Роман Шаронов. Уже на стартовом отрезке чемпионата «Рубин» сделал заявку на успешное вступление, одержав семь побед подряд. В дальнейшем в течении всего турнира казанцы подтвердили свои претензии на самые высокие места. И за три тура до окончания чемпионата «Рубин» впервые в своей истории стал чемпионом России.

Рубин - чемпион России!

В сезоне-2009 «Рубину» впервые предстояло защищать чемпионский титул. В межсезонье казанцы укрепились защитником из Испании Сесаром Навасом, а так же рядом российских игроков. Перед самым стартом чемпионата в «Рубин» вернулся аргентинец Алехандро Домингес. Покинули команду ветераны Саво Милошевич и Сергей Ребров. В мае казанцы впервые вышли в финал Кубка России, но проиграли ЦСКА. Всё решил гол, пропущенный на последней минуте матча. Осенью «Рубин» впервые стартовал в Лиге Чемпионов УЕФА. Казанцы одержали победу над знаменитой испанской «Барселоной» на её поле со счётом 2:1 и закончили групповой этап на третьем месте. Это позволило «Рубину» продолжить выступление в Лиге Европы. Самым ярким событием осени-2009 стало завоёвание «Рубином» второго подряд титула чемпионов России.